放弃将沈阳主力撤至锦州的想法。他召见卫立煌拟亲自说服卫将沈阳主力撤至锦州。卫于3月31日中午过北平，在机场与傅作义长谈后，由北平飞南京，当晚向蒋介石汇报东北情况。蒋介石向卫说，沈阳、长春交通断绝，单凭空运补给无法维持。蒋一再要卫将沈阳主力撤至锦州，在沈阳、长春留少数部队防守。卫以部队残破未加整训完成，不可能打到锦州，反而有被消灭的危险为由，陈词婉拒。
蒋唉声叹气地说：“我们运输机及汽油都无法维持东北这样庞大部队的补给，情势所迫，不得不将东北主力撤到锦州。”
卫从未看到过蒋有这样的窘态，于是对蒋说：“只要不将主力撤出沈阳，东北部队补给由我负责，请美顾问团帮助运输。”
蒋介石说：“好！好！只要你对于部队补给有办法，也可以照你的意见暂时不撤往锦州。但是一俟补充整训完成，仍要赶快打通沈锦线。”
卫立煌应允了。卫对随行的补给司令刘耀汉说：“我把东北的补给包下来了，明天请你到美军顾问团，请他们帮忙运输……。”第二天卫立煌拜会美军顾问团团长巴大维，巴大维原则上同意尽量协助。卫再见蒋介石，蒋答应照卫的计划先巩固长春、沈阳、锦州三大战略要点，待部队整训完毕，再打通沈锦线。
5月11日，美顾问团团长巴大维亲率美顾问及译员共9人赴沈视察，并会见卫立煌。除了巴、卫间秘密交涉外，公开宣布顾问团这次来沈阳的主要目的是：
(一)视察飞机场的设备及容机量；
(二)找仓库，准备运输十个师的美式装备，预定在1949年3月、4月间运到；
(三)视察新编第一军、新编第三军、新编第六军及第二○七师等美械装备部队，准备将超龄的轻重武器加以更换。
视察后卫立煌对郑庭笈说：“十个师的装备来到就有办法了”。蒋介石这时见东北各将领上自总司令卫立煌，下至兵团司令官、防守司令、军长，都不同意他的方案，于是决定将范汉杰的冀热辽边区司令部由秦皇岛移到锦州。蒋要范准备打通沈锦线，并由山东抽调第九军黄淑部及第五十四军阙汉骞部两个军由葫芦岛登陆归范指挥。
6月初，蒋介石要范汉杰加紧准备打通沈锦线。这时卫立煌主张巩固沈阳、锦西、葫芦岛防务。对此，蒋、卫间有几度争执，7月卫立煌奉召到南京见蒋时解决这一问题，蒋介石同意将冀热辽边区司令部改为东北“剿总”锦州指挥所，仍由范以东北“剿总”副总司令兼锦州指挥所主任坐镇锦州。卫立煌主张指挥所设葫芦岛，蒋主张必须设在锦州，以后卫要范移驻葫芦岛，范也是听蒋的指示，不理卫的意见。据范汉杰说，南京国防部熟悉内幕的人说，蒋介石原拟要廖耀湘将沈阳主力带到锦州，即将东北国民党军全权给廖，以后见廖受卫立煌的牵制，不能执行蒋的命令，又拟以范汉杰打通沈锦线，撤出东北主力，将权力交给范。
蒋介石指挥作战，不分析敌我态势、兵力对比及士气战斗力等客观条件，只是从他的主观愿望出发，只要将领听他的命令。蒋介石为了把东北主力撤到锦州，用尽心机在东北物色能执行他命令的将领。初则属意于廖耀湘，后又属意于范汉杰，而把卫立煌悬在一边。弄得在东北的国民党将领中，各有所私，各怀鬼胎，各据一部分实力，个个要直接听蒋介石的命令，谁也无法统一指挥。而蒋、卫矛盾的焦点仍然是打通沈锦线将主力撤到锦州的问题。
卫立煌与蒋介石之间的矛盾，到了后来演变成为不论什么事，蒋介石要这么办，卫立煌偏偏要那么办，样样都闹拧。除了对东北作战主张的分歧，如美国人希望国民党守在东北以免俄国势力扩张，在1948年，表示愿意再增加空运东北十个师的装备和补给。卫立煌经过远征军和访问美国和美国人关系很好，向美国顾问团长巴大维请求，把这些物资直接运到东北，不经过南京。
巴大维久已讨厌南京政府的后勤部门，因为运来什么东西都被他们贪污盗卖或移作他用。他特地到东北做过—些调查，看了机场仓库等情形之后，决定直接用船运东北营口。这事被蒋介石闻悉之后，十分震怒。美、卫直接挂钩，把他撒开，那还了得？那不但会使东北演变成一个独立的小国。更会损害他总统统一的权力。他横加干涉，争争吵吵，美国人对东北运送器械军火一事终于没有办成功。