涂以黄金，披着锦采的袈裟。因此，也可以设想金陵一带的佛教是由笮融最早传来的。
孙坚死后，孙权的大哥孙策向袁术讨回了其父的余兵千余人，带到历阳与舅父吴景会合，准备恢复江东。公元195年（汉献帝兴平二年)，二十一岁的孙策在周瑜、程普和黄盖等人的协助下，从历阳渡江而东。他的军队所向披靡，首先击溃了刘繇的牛渚营(今当涂县采石矶)，取得大量的军粮和武器，接着就攻打秣陵县城。但是，孙策在攻秣陵的战役里股部被弓箭射伤，被抬回牛渚营，当时秣陵城内盛传，“孙郎被箭已死”的谣言。这样，就造成了笮融军队的麻痹大意，孙策带伤出战，大败笮融，先后攻下湖熟、江乘和袜陵这三座县城，威名大振。不久，孙策又乘胜攻取了吴郡(今苏州一带)、会稽(今绍兴一带)、庐江(今安徽巢湖一带)和豫章(今江西南昌一带)四郡，从而奠定了东吴立国的基础。可惜，孙策本人在三十六岁时就被人刺杀于丹徒(今镇江市)，这时候孙权才十八岁。
在越城东北约两公里的秦淮河南岸，还有—座丹阳郡城的遗址，它的大体位置在今城南武定桥的东南一带。据史书记载，这城的面积为一顷(一百亩)，开有南、北、东三门，而无西门。这座丹阳郡城是东吴建国前一年(公元221年)创立的。最早在这里担任太守官职的是大将吕范，他还兼任扬州牧(相当于省一级的军政长官)，负责留守建业(今南京市区)。当时孙权正以长江中游的湖北公安和武昌(今湖北鄂城县)为政治中心，同刘备的大将关羽争夺荆州(今湖北江陵一带)的控制权。后来，两晋和南朝也都继续使用这座丹阳郡城。
从越城向西北行，渡过内、外秦淮河，大约五华里路程，就到了古冶城遗址，现在的地名叫朝天宫。朝天宫所在的山岭古称“冶城山”，相传是春秋末年吴王夫差铸造兵器的地方，据说在冶城山下还有一座与苏州虎丘同样的“剑池”。吴国素以出产锋利的兵器而闻名。南京地区的铜矿资源较为丰富，西南郊的铜井镇和铜山一带很早就发现铜矿，也有少数锡矿和铅矿，这些都是铸造青铜兵器所不可缺少的原料。因此，我们认为这个传说是有根据的。不过，它不一定是军事防守性质的城池，而是一座规模较大的冶炼作坊罢了。还有一种说法认为冶城是东吴时的官营冶炼作坊，不会早到春秋时期。其实，这两种说法并不矛盾，很可能东吴的冶城是在春秋时吴国冶城的基础上进行恢复和扩建而成的。
自朝天宫的古冶城向西北行，约三华里许到今汉中门，再从汉中门外沿城墙北行不远，就到了古石头城的西壁遗址。石头城的历史可以上溯到战国中期楚国在此设置的金陵邑，这是公元前333年的事情。楚国的威王灭越后，尽占吴国故地，就在今清凉山上修筑了一座城邑。因为那时紫金山叫作金陵山，所以把此城命名为金陵邑。又传说楚威王曾经在今狮子山以北的江边(古称“龙湾”)埋过黄金，以压“王气”，因而称作“金陵”。由于当年的长江还在清凉山的西麓下流过，金陵邑临江控淮(秦淮河)，形势十分险要。它是南京地区年代仅次于越城的第二座古城，南京的古名金陵亦始于这时。
前面我们已经提到，东汉末年时，孙权在诸葛亮、刘备的先后建议下，于公元211年把政治中心从京口迁来秣陵，第二年在楚国金陵邑的基础上修建石头城的历史。这座石头城的大小约与清凉山的范围相当，城周为七里一百步，相当于现在的六里左右。南面开有两门，东面开一门，西北因紧临大江，所以不设城门。城基都是利用清凉山的天然岩石，因为当时清凉山名叫石头山，所以此城就称为石头城。又由于清凉山的主要岩石是一种红色的砂砾岩，尤以西部的峭壁暴露得最为明显。该处因历经江水冲刷，岩壁表面凹凸不平，有如兽面似地突出在江边，因此又被人们称为“鬼脸城”。这座山城在东吴及其后的东晋和南朝各代，都被用来作为水军根据地和首都西面的军事重镇，这方面的情况我们还将在后面予以叙述。
由石头城沿江向东北走，抵今下关以东一带，就到了古江乘县的辖境，这是一个从秦代起就开始设置的县份。在公元前210年秦始皇东巡时，先经过丹阳(即今小丹阳)，至钱唐(今杭州市)，临浙江(今钱塘江)，上会稽(今绍兴会稽山)。归途中经过吴(今苏州市)，并从江乘渡江北返，而江乘县就是这个时候设立的。关于江乘县城的所在地，过去一般都说是在句容县北六十里。我们认为其具体位置应在今南京栖霞山附近，因据明代南京地方志记载，古江乘县在当时的长宁乡，而长宁乡正是位于栖霞山一带。它的对面是六合县的瓜埠镇(古代称瓜步)，也是历史上有名的长江渡口和军事要地。
此外，在今长江北岸的大厂镇一带，过去称为“卸甲甸”。相传该处就是楚霸王项羽在“垓下之战”失败以后，向江东撤退途中卸甲休息的地方。据说，项羽离开卸甲甸后，沿着长江北岸退到今安徽和县境内，最后终于自刎于乌江(今和县乌江镇)。
在今日南京市属六合县城的西北，还有一座东周和秦汉时代的棠邑故城。棠邑在春