治委员，刘岱峰任副司令员，姚继明任副司令员兼参谋长，邓存伦任政治部主任，下辖供给、卫生、兵站等部，军械处仍隶属于司令部，各兵团亦设置后勤部。
第三野战军设后勤部，刘瑞龙任部长兼政治委员，喻曼云、李厚坤任副部长，谢胜坤任副政委兼政治部主任，张元培任参谋长，下辖供给、卫生、军械、运输等部。
第四野战军设后勤部，周纯全任第一部长、李聚奎任第二部长，陈沂任政治委员，罗文任参谋长，潘振武任政治部主任，下辖司令部、政治部和供给、卫生、军械、运输等部以及6个分部。军需部由杨至成任部长，魏庭槐、张庆孚任副部长，下辖第1、第2、第3局和军需学校。
西北军区设后勤部，陈希云任部长，刘海滨任政治委员，何维忠、周子祯任副部长。
华东军区设后勤部，宋裕和任部长，邝任农任政治委员，伊文任参谋长，罗应怀任政治部主任，下辖供给、军械、运输等部。
东北军区设后勤部，朱治理任副部长，下辖经理、军需、军械、军工、卫生等部。
华北军区设后勤司令部，赵尔陆任司令员，黄敬任政治委员，吴先恩任参谋长，下辖供给、卫生、兵站等部。
在整编中，各野战军和大军区先后召开了后勤工作会议，传达学习全军后勤工作会议文件，统一思想，并制定了实施细则、补充办法等，使后勤工作更好地保障向全国进军任务的完成和部队的正规化建设。
为了保证全军在向全国进军过程中的物资供应，中共中央于1949年3月20日颁发了《关于经济工作及后方勤务工作若干规定》，其中规定：东北、中原解放区负责供应第四野战军；西北解放区及华北解放区的主要部分负责供应第一野战军及第18、第19、第20兵团；华东解放区负责供应第二、第三野战军，不足部分，由中共中央从华北、东北解放区调剂。各野战军在新区及城市缴获的军用物资，于接收后，除必须补充其本身者外，应将其重要部分报告军委，以便调剂。
3月21日，中共中央又颁布了《关于新区筹粮的规定》，指出：大军南下，进入新区后，民主政权尚未建立或刚刚建立，公粮制度一时尚不能实行，除以缴获粮及伪政府屯粮拨充军粮外，不能依赖后方供给，主要地必须采取就地征借办法，解决军队粮草供应问题。根据合理负担的原则，征借的主要对象是地主、富农，其次是中农。按其粮食总收入作标准，地主征借40～50％，富农25～35％，佃富农20％，中农10～15％，贫农一般不借，只有在万不得已时，才可少借一点。
马草根据需要按一定比例随粮附加。南下的部队，可以团为单位，在政治部的领导下，由随军的地方工作人员及供给人员组成粮秣工作队，负责筹粮。当地保、甲长及差务处之类的组织，凡可利用者均利用之，配以民主评议，进行征借。粮秣工作队则一面监督他们，一面到群众中去宣传解释我们的借粮政策和其他各种政策，检查保、甲长或差务处对借粮政策的执行情况。无保、甲长或差务处可资利用者，则由工作队直接办理征借。在新区，应坚持财粮制度，爱护人民的财富，反对浪费。严禁以粮食换各种物品。粮秣由工作队按规定发给各伙食单位。不经过粮秣工作队，任何人不得直接征用粮草。
为此，最好以军区或野战军为单位，印制统一的借粮证，由粮秣工作队统一填用。粮秣工作队有供给部队粮秣之责，也有检查粮秣开支之权。征借粮秣时，一面要保证部队需要，另一面也要照顾到当地的能力，并注意了解有无部队征借过及征借多少，据此才能决定征借的数量。粮秣工作队应建立简单的收支帐目，各级政治部门及首长要注意经常检查。
同时，要尽可能地分散征借，不要只顾一时方便而集中一地征借，免使群众一次出粮太多，引起反感，并影响后来部队无粮可借。进入城市部队的粮秣供应，则主要依靠缴获解决，如缴获不敷而又无粮接济，可经过商会向粮商暂时借用或定购短期的粮食，再由商会负责筹款折价偿还。
各野战军为了认真执行中共中央上述的规定，分别下达了补充指示，以加强对筹集粮草工作的领导和督促检查。
经过全军上下的一致努力，到1949年4月初，全军已经从思想上、政治上、组织上和物资上做好了向全国进军的准备。只待中共中央、中央军委一声令下，人民解放军即可向残存的国民党军队发起强大的追击作战，解放全中国。