重打击后，逃到海南岛的残兵败将拼凑起来的部队，他们惊恐未定，立足未稳，兵员不足，斗志涣散，内部派系斗争复杂，国民党中央军、广东军阀余汉谋部，陈济棠部及当地地方军之间矛盾很多。
5个军中只有牛央军第32军尚有2万余人，其余各军兵力只有1万人左右。他们逃到岛上的时间还不长，布防在环岛1200公里的海防线上，因此，海防工事构筑不坚固，永久性工事还未来得及构筑，沿海空隙甚多。敌空军人员贪生怕死，很怕我军的高射炮火，敌海军则缺少作战经验。总的来说，敌军士气低落，战斗力不强，薛岳还没有料想到我军会很快组织渡海登陆进攻。
从我方来看，我军渡海兵团的2个军，都是四野的主力，兵员充足，装备齐整，士气高昂，加上配属的部队，总兵力达10万人，还有岛上琼崖纵队约15000人。我军是胜利之师，指战员有高度的阶级觉悟和很强的战斗意志，有丰富的作战经验，能够战胜任何困难，这就从气势上压倒了敌人；加之，我以集中兵力进攻分散防守之敌，这就使我在登陆地段上，与敌人兵力对比占有优势；特别是岛上有我党冯白驹同志领导的琼崖纵队相接应，又有人民群众的支援，这就为我军胜利登陆作战、迅速解放海南岛，奠定了很有利的基础。
邓华司令员在讲了兵团党委分析我军的困难和需要解决的问题后说：遵照上级的意图和对各方面情况的分析，兵团认为：海南岛上有国民党军10余万人，如果首先就采取大规模登陆，速战速决的方针，则需要很多的机帆船，改装费用会很大，也很难在几个月内完成，毛主席要求我们一次要渡一个军，时间可以在春夏两季解决海南岛问题，但我们绝不能因此而放松准备工作。
邓华司令员说：我们考虑，渡海作战与陆地作战不同。陆地作战搞不好还可以整顿部队重来，渡海作战搞不好就会有全军覆灭的危险，因此必须慎重从事。既要英勇果敢，又要稳扎稳打。必须实事求是，因时因地采取得力措施，并准备以必要的代价，克服敌机敌舰和茫茫大海的阻拦，使部队顺利登陆，才能大量消灭敌人，取得渡海作战的胜利，这就是我们作战的指导思想。
兵团决定采取的作战方针是，积极准备，首先以小部队乘坐木帆渔船进行偷渡，加强琼崖纵队的力量，改变岛上的形势，破坏敌人的防御准备，为大举登陆创造有利条件。尔后以两军主力实施强行渡海登陆作战。至于如何偷渡，待会议后，将我们的决心及实施方法与步骤，请示四野总部和中央军委批准后，再电令你们执行。
邓华司令员说：在战役准备阶段，实施小部队分批偷渡。小规模偷渡主要乘木帆船，在海上可以伪装成打渔船，从海南岛两侧敌人防御薄弱地段乘隙偷渡登陆。由琼崖纵队派部队接应偷渡部队。只要登陆成功，就是胜利。因为海南岛是个大岛，回旋活动的余地大，又有岛上的党的组织、琼崖纵队和人民群众的支援、帮助，可以迅速进到我根据地内。
所以，兵团坚信小规模偷渡是可以成功的。要求43军先准备一个加强团，加紧收集船只，雇请船工，加强海上训练，争取在一个月左右时间内作好准备，预定3月上旬实施第一批小规模偷渡，40军也应准备一个加强团，参加偷渡。2个军选择登陆地点时，应请教琼崖纵队同志选择那些登陆地点最好。登陆地点和登陆时间确定后，报兵团批准。兵团即电告琼纵作好准备，适时接应偷渡登陆部队。偷渡的准备工作要特别注意保密，才能出奇制胜。
邓华司令员说：由于沿海渔船有的被逃跑的国民党军抓去了，有的被各地渔霸带着逃跑了，在短时间内收集大量的船只有困难。遵照毛主席关于在几个月内装置几百个大海船的机器，争取于春夏两季内解决海南岛问题的指示，四野总部已派后勤部政委陈沂同志到广州与华南分局研究商量，准备设法去香港购买发动机和登陆艇。因此，大举登陆的载运工具重点放在改装机帆船和购置登陆艇上。
买发动机和登陆艇需要一定时间，为此，兵团遵照毛主席的电令，决定将大举登陆准备的时间推迟到5月底准备完毕，6月大举渡海进攻海南岛。但是，两军不要因为渡海准备时间推迟而放松准备工作，参战部队要抓紧时间搞好海上大练兵，落实兵团提出的“把陆军练成海军陆战队”的战斗号召。两军都要组织人员与当地气象台站合作，了解掌握琼州海峡的气象和海水潮汐、流向的情况，研究分析找出其规律来。还要强调一下，就是要抓紧搞好雇请船工和收集船只的工作，这是关系到我军能不能迅速渡海作战的重大问题，也是一项政策性很强的工作。
邓华司令说：我军绝大多数是东北人，听不懂广东方言，当地干部与人民群众也听不懂东北话，因此，要请地方党、政机关多帮助。兵团已建议四野后勤部迅速在北海、湛江、海康、徐闻开设兵站。为了便于与岛上琼崖纵队取得联系，及时互通情况，协调渡海登陆作战有关事宜，除了兵团和2个军与琼崖纵队沟通电台联络外，请琼纵马白山副司令员和符振中参谋长商量，请你们派琼纵干部到两个军前指(注：40军前