久也要撤离。今后，国民党必然会在其统治区加强对人民的镇压，要提高警惕。你们回北平后，要充分认识到北平情况与昆明的不同，要有长期进行艰苦斗争的思想准备，绝不可追求表面轰轰烈烈，要扎实地开展工作，学会在群众中隐蔽自己。”她还特别强调：要广交朋友，既要打破进步同学的小圈子，也要打破南方复员来的同学的小圈子。
离开南京后，按照“转地不转党的原则”从重庆来的地下党员的组织关系，仍由南京局领导。地下党员和党的秘密外围组织民主青年联盟的成员紧密配合，开展了广交朋友，做好新人学同学和原北方学校同学的工作。通过民主竞选，南系地下党组织在清华大学掌握了学生自治会的领导权，在北大掌握了文学院的领导权，为开展公开合法斗争创造了条件。各校根据同学们的兴趣爱好，扩大和建立了各种社团组织，有政治性较强的读书会，各种壁报社、研究会，有歌咏、剧艺等文艺社团。校内活动生气勃勃，从而团结了一批同情共产党、拥护共产党主张的积极分子。以后，征得钱瑛同意，南系党组织与中共北平地下学委书记佘涤清等建立了联系，但在组织上各自独立，不发生横的关系，仅在工作上相互配合。
碰头会上，佘涤清情绪激昂地对袁说：“美帝支持国民党打内战，美军在中国为非作歹，人民群众早已不满，我们应抓住这一事件，高举维护民族尊严的旗帜，激发广大群众的义愤，放手发动同学掀起抗议美军暴行的运动。”
袁永熙说：“是的，美国大兵在中国犯下的累累罪行，是到了该清算的时间了。但是，北平反动势力不可低估，我们要吸取过去的经验和教训，注意有理有利有节，根据需要和可能发动和布置行动。”
佘涤清也说：“被强奸的女生是北大同学，因此，北大的宣传、发动是重点，首先要做好北大的发动工作。”
“清华的进步力量占有优势，可由清华公开、合法地与各校串联，以影响、推动各校的运动。”袁永熙摩拳擦掌地说。
会后，二人便分头行动起来。抗议的大字报、抨击文章、壁报、漫画很快贴满了北大、清华的民主墙。
当天下午，北大的女同学召开了抗议大会，晚上，各系科的社团、系科代表会又正式通过决议：分别致书蒋介石，司徒雷登、马歇尔、杜鲁门，抗议美军暴行，发表了《告全国同学书》、《告全国同胞书》，抗议美军暴行，把美国兵赶出中国去，呼吁全国学生联合起来，首先罢课一天，必要时游行示威。
26日、28日，北大、清华学生为强烈抗议美军士兵强奸中国女大学生，分别举行了罢课抗议。
国民党当局看事态发展对他们不利，于是三青团、特务匆忙上阵，撕大字报，编造谣言，污蔑沈崇是妓女，妄图掩盖真相，结果是欲盖弥彰。当北大同学将访问到的沈崇身世公布后，群众怒火更旺。
29日，南京局平津南系党组织迅速做出决定，发动尽可能多的学校参加示威游行。当晚，北大召开全校院系代表大会时，国民党北平市党部竟纠集100多名特务、暴徒，提前闯入会场，大打出手，并威胁要以机枪对付学生运动。他们的丑劣表演恰如火上浇油，群情更加激愤。
30日，北大、清华、师院、中法、辅仁、朝阳等校万余人举行了声势浩大的“抗议美军暴行”大游行。接着，天津南开、北洋等29所学校万人又走出校园举行游行，抗暴斗争浪潮迅速席卷全国。
北平大学生奋起抗暴的消息传到上海，中共中央南京局上海工委负责学运的朱语今，于27日和29日连续召集上海几所大学的地下党员开会，决定采取行动，声援北平学生运动，抗议美军暴行。经上海工委书记华岗同意后，上海的一些大学首先开始了行动。
周恩来敏锐地洞察到这场爱国民主运动所蕴藏着巨大潜在力量和光明前途。
为加强对这一运动领导，他在12月31日为中共中央起草了给当时还留在国统区的董必武、吴玉章、张友渔、叶剑英、刘晓等人电报，指出“北平学生因美军强奸女学生事，已造成有力的爱国运动。上海、天津闻亦将响应。望在各大城市（平、津、京、沪、渝、昆、港、榕、杭等）及海外华侨中发动游行示威，并坚持下去。不能游行的地方，亦可进行请愿及组织后援会。”周恩来要求国民党统治区地下党组织将运动推向各地，使之不断发展，向各方呼吁声援，“务使此运动向孤立美蒋及反对美国殖民地化中国之前途展开”。
各地党的地下组织接到中共中央通知后，立即紧急通知各校党组织，大胆、充分发动群众，投入到抗暴斗争中去。
30日，上海暨南大学全校举行罢课，校门内外到处是揭露和抗议美军暴行的标语，漫画和美军暴行录。19个联络小组分头赴各兄弟院校联络，争取上海全市学生统一行动。
中共代表团驻沪联络处潘梓年、陈家康就美军暴行也公开发表谈话。陈家康说：此事件引起各地很多学生的义愤，足见中国人的心未死，我们决不愿当亡国奴，国民党政府要拿出良心来，切勿再