光武帝以幽、燕骑兵平定天下，故在黎阳立营，由黎阳谒者负责监管。营内有骑兵千人，权责甚重，谒者位轻，故从顺帝开始，改用府掾中有清名威重者担任。
车郎将、户郎将、骑郎将：并称三将，东汉时裁撤。
卫尉寺：
卫尉：一名，九卿之一，中二千石。负责宫门、宫中的巡查守卫。
卫尉寺丞：比千石。
公车司马署
公车司马令：或称“公车令”，六百石。负责管理南阙门，接待官吏百姓的上书、四方贡品以及被征召至公车府者。
公车司马丞：一人（《通典》说二人），选择通晓各种禁忌的人担任，负责处理不法之事。
公车司马尉：一人，主管阙门守军禁令，防备突然事变。
南、北宫卫士令：南、北宫各一人，六百石，负责分别掌管南、北宫卫士。
南、北宫卫士丞：南、北卫士令下各一人。
左、右都侯：各一人，六百石。主管剑戟士，负责巡查宫廷以及皇帝要求拒捕拷问的人。
左、右都侯丞：左右都侯下各一人。
宫门司马：宫中所有旁门，每门设司马一人，共七人，比千石。
南宫
南屯司马：主管平城门。
苍龙司马：主管东门。
玄武司马：主管玄武门。
北屯司马：主管北门。
北宫
朱爵司马：主管南掖门。
东明司马：主管东门。
朔平司马：主管北门。
司徒负责太仆、廷尉、鸿胪。
太仆寺：
太仆：一人，九卿之一，中二千石。掌管车马。皇帝出行，奏请车驾扈从仪仗；皇帝乘大驾则亲自驾车。
太仆属员：
太仆寺丞：一人，比千石。
考工令：一人，六百石。主管刀剑、弓圞弩等兵器的制圞造，成品由执金吾存入武库。并管理织造绶带的工匠。
考工左、右丞：各一人。
车府令：一人，六百石。主管皇帝的各种车辆。
车府丞：一人。
未央厩令：一人，六百石。主管车驾和宫中马匹。
长乐厩丞：一人。
廷尉寺：
廷尉：一人，九卿之一，中二千石。献帝建安年间，改称“大理”。负责审理案圞件，奏请应叛之罪；凡郡国中有疑难的案圞件，都要给予适当的判圞决。
廷尉正、左监：各一名。
左平：一名，六百石。负责审理皇帝下诏的案圞件。
洛阳诏狱令：负责管理设在洛阳的诏狱。
鸿胪寺：
大鸿胪：一名，九卿之一，中二千石。管理于诸侯以及四方归附的蛮夷相关的事务；举行祭祀大典时，负责接待引导宾客，奏请行礼，得到许可后，传命各司；诸侯王入朝，负责到郊外迎接，主持接待的仪式；上计时，接待各郡国的使者；皇子封王，协助授予印绶；拜授诸侯、诸侯嗣子以及四方夷狄受封者时，由台下的鸿胪召请拜任；诸侯王去世时，遣使吊唁，并拜授嗣王。
鸿胪寺丞：一人，比千石。
大行令：一人，六百石。主管诸郎官。
大行丞：一人。
治礼郎：或称“治礼员”、“理礼郎”，四十七人。
公室、主调中都：秩斗食。
鸿胪：三十六人。
司空负责宗正、司农、少府。
宗正寺：
宗正：一名，九卿之一，中二千石。两汉时，均用皇族担任。主管登录各王、各诸侯国嫡庶族谱及各宗室亲属间的远近关系，以及各郡国随着计簿上报的宗室名册；宗室中，若犯有处罚在剃发之刑以上的，先上报宗正，宗正上报皇帝后，方可执行。
宗正寺丞：一人，比千石。只能以皇族担任。
公主家令：各个公主，每个公主设有家令一名，六百石。
公主家丞：公主家令下设丞一名，三百石。
其他属员增减没有常规。
司农寺：
大司农：一人，九卿之一，中二千石。建安中，改为“大农”。掌管钱、谷金圞帛及各类货币；各郡国每季度上报月初一时现存钱谷的账簿，尚未缴齐的赋税，另立账簿以区别；有边郡各官请求调度钱谷者，都予以调济，取多补少，互相补足。
司农寺丞：一人，比千石。
部丞：一人，六百石。负责管理国库。
太仓令：一人，六百石。负责接纳各地运到京圞城的粮谷。
太仓丞：一人。
平准令：一人，六百石。负责平抑物圞价，管理漂染丝帛。
平准丞：一人。
导官令：或称“东京令”，一人，六百石。负责舂制御米，以制圞作干粮。
导官丞：一人。
廪牲