本五十六费心制造的微型潜艇已经潜入珍珠港，并且开始攻击。
美国驱逐舰海尔姆号是第一艘开始对驶入珍珠港内的日本潜艇攻击的美国船只。
美国莫纳汉号驱逐舰与一艘日本潜艇相撞并开始投深水炸弹。潜艇受伤后上浮。
九点还未到，日军的第二波攻击开始。
由54架轰炸机和78架俯冲轰炸机进行攻击，36架战斗机夺取制空权。
一艘荷兰的远洋轮是第一个参加战争的美国同盟者。
但面对日军的轮番轰炸，就算是，远洋游轮又如何。
珍珠港又接受了半个长达半个小时的俯冲轰炸，这是在珍珠港已经浓烟滚滚，严重妨碍了俯冲轰炸机，寻找下面的舰只，日军99式轰炸机，采取了根据弹幕轰炸的方式，哪里有高炮最为猛烈，飞机飞向哪里俯冲。
这时已经是，上午十点，第一波飞机回到停在岛北180海里的舰队。
珍珠港内战役战略舰队末尾的内华达号战舰是唯一离开泊位的舰船，他见证了日军从开始的疯狂轰炸，到最后只留下一架飞机。
这架飞机正是第一指挥编队的指挥官原田的座机。
原田的座机在珍珠港上空盘旋许久，原因是原田要拍下自己胜利的照片。
日军空袭过去了，夏威夷总督在电台中宣布整个夏威夷领地进入戒严状态。
而他在半个小时后却听到了自己不想听的消息。有人报告日军在欧胡岛登陆。
急忙派出美国侦察机飞向岛北但未能发现任何敌机或敌舰。夏威夷总督和美国总统同意在夏威夷引入战时法并建立军政府统治。
这是山本五十六与南云中将讨论进行第三波攻击的可能性。
南云一声返航，打得日军编队开始由南向北。