涿鹿之战结束后，黄帝带着杀伐肃穆得瑟轩辕剑单挑赢勾，这场大战持续了七七四十九天，最终在轩辕剑加持下，黄帝毁了赢勾肉身，然而他的魂魄却带着无尽尸气逃之夭夭，从此不知所终。
犼的另一缕残魂飘入了后卿躯体内，后卿身前是黄帝麾下一员工大将，是厚土的弟弟，在黄帝麾下颇受重用，在这次战争中后卿不幸战死，后卿生前为黄帝拼死杀敌，死后却曝尸荒野，他怨念日益加深，魂魄游荡在尸体周围，恰逢这时犼的一份残魂飘到这里，后卿为了向黄帝讨个说法，同意将自己的三魂七魄和犼一缕残魂融合，后卿就此复活。
死而复活的后卿只是一只会飞的僵尸，他虽然能力一般，却拥有了一种极为可怕的力量——诅咒之力。后卿为了报复黄帝，大闹黄帝阵营，女娲闻讯赶到，将后卿除去，后卿死前用自己的灵魂对所有含冤而亡的尸体下了一个诅咒——诅咒所有含冤而亡的尸体都可以变成僵尸，后来为了防止尸体变为僵尸，出现了火葬。
犼尸体被女娲和伏羲封印后，居然发生了一场变故。这场事故是这样的，犼很久以前向昊天要了一枝神树树枝，犼被封印后，神树树枝趁虚而入，居然在犼身体里生根发芽霸占了犼的身体，变成了吸血僵尸之祖——将臣。将臣因为是犼躯体和神树融合而生，没有灵魂，必须吸食含有精魄的人血滋养躯体。并且将臣牙齿上含有病毒，所有被将臣吸食过血液的人都会尸变，所以我们现在电视里见到的所有吸血僵尸都是将臣的后代。
言归正传，蚩尤一族凭借收编的魑魅魍魉的妖术，多方变幻，呼风唤雨，吹烟喷雾，使三日三夜大雾冥冥，军士不见天日，难辨山川四野方向，困黄帝于太山之下，黄帝节节败退，拼死奋战，九战不胜。
幸好皇帝旗下能人众多，当时在黄帝手下混饭吃的有个叫风的奇人，他舒徐磁石特性，这天晚上他夜观天象，在北斗七星的启发下，既然磁石在水平安放、转动自由的条件下，静止时，两端必指南北。在这启发下，风发明了指南车。风指挥军中工匠，造了一辆车子，车上站一个木人，木人伸一只手，手伸一根指头，无论车方位如何，木人伸出的手都能准确无误的指向南方。靠了指南车的引导，黄帝带领近卫军向正北方发起冲锋，终于突破了大雾的重围，摆脱了蚩尤的追杀，引兵退归太山之阿，夜间昏然忧寝。
昊天看着黄帝又打了败仗，心中又气又急，增援再次升级，再次派玄女下界。玄女下界后先传授了黄帝领兵作战之法，并赠送黄帝兵法奇书《黄石天书》，教授了黄帝三宫五意，阴阳之略，太乙遁甲、六壬步斗之术，阴符之机，灵宝五符五胜之文，以及兵符印剑 。为了确保此次战争的胜利，九天玄女觉得老是玩迷雾模式不是个事儿啊，得想个办法来一次五对五真正王者pk。这昊天为了香火也是蛮拼的，为了让黄帝打赢战争，又派神将助黄帝打造轩辕剑。
黄帝学会兵法后，玄女又指导黄帝派人去昆吾山开采铜矿铸轩辕剑，轩辕剑乃神造之器，铸成之日，天地动荡，发出雷鸣般的嘶吼声，周围生灵死伤殆尽，为了铸成轩辕剑黄帝一族死伤无数。但此时黄帝士兵士气低落，为了鼓舞士气，黄帝又把主意打到了东海流波山上与世无争的夔牛身上。夔形貌似牛，体色苍灰，独腿，头上无角。它目光如日月辉映，声音似雷霆轰鸣，每当它出入海水，必定伴随著大雨大风。
嗓门太大给夔牛带来了杀身之祸，在九天玄女的协助下，黄帝派他儿子东海神禺号将夔捕来，将它剥皮抽筋，剥下的皮晾干，制成了一面战鼓。 战鼓有了棒槌呢？黄帝这时又把心眼打到了雷神身上，雷神住在雷泽里，长着人头龙身，平时也与世无争，喜欢拍自己肚子玩，每拍一下就发出雷鸣般的声音。这丫是伏羲的爹，传说华胥氏从前在雷泽里过路，不小心踩了一下雷神的脚板印，于是怀孕生下了伏羲。黄帝连夜派人奔赴雷泽，这神通广大的雷神，被黄帝盯上了后就像残血被隐身的兰陵王追杀的似的，被黄帝那支扫雷没两下就弄死了，雷神被杀后扫雷对待夔的方法再一次用到了雷神身上，又是扒皮抽筋。更残忍的是，雷神扒皮抽筋不是最终目的，扫雷队的目的是抽雷神大腿骨做棒槌，所以这次雷神受到了比夔牛更残忍的对待。
大战再一次打响，黄帝挂着轩辕剑，手持棒槌，雷神腿骨做成的棒槌敲打在夔牛制成的战鼓上，发出的声音惊天动地，响彻云霄，五百里内都震耳欲聋。
黄帝站在山顶，命力牧边战边退，诱敌深入。看见蚩尤军队全数进入包围圈后猛力敲击夔牛鼓自打夔牛鼓敲响后，战况急转而下，这响彻云霄的声音吓得蚩尤一族丢兵弃甲，士气衰退，三通鼓罢，三苗之民面无人色；六通鼓罢，魑魅魍魉魂飞魄散；九通鼓结束，蚩尤兄弟手颤足麻，无法跳跃飞腾。只见整个战场地动山摇，天旋地转，喊杀冲宵汉，使蚩尤兵卒神魂颠倒，冲杀元门，败倒如山。
而黄帝这厢，把轩辕剑舞得上下翻飞，青色剑锋喷射出赤色光焰，再加上神力的加持，削落蚩尤兄弟的铁额铜头，轻巧得如同切菜砍瓜；这时候救援的女魃和应龙都赶到了。