人心中不满，按说这些应经内阁和朝臣商议的，但皇帝想培养自己班底，也算正常，其实再怎么考核，还不都是大家的学子学孙，有什么区别，所以也没有反对。
百官纷纷赞同：“臣等遵旨！”
朱由检点头道，“孙太傅，你即刻前往辽东，整顿边军，抵御后金入侵；秦将军，你率白杆兵进驻京城，负责京畿卫戍；骆养性，你尽快整顿国家安全部，清查阉党余孽与贪官污吏；王承恩，你负责清洗皇宫内部，筹备大明医学院；其余卿家，各司其职，恪尽职守，不得有任何懈怠！”
“臣等遵旨！” 百官齐声应道，心中充满了敬畏与忐忑。
退朝后，朱由检又在书房与孙承宗密谈。
“陛下，如今阉党余孽尚未清除干净，东林党势力庞大，陛下还需小心谨慎。” 孙承宗忧心忡忡地说道。
“孙太傅所言极是。” 朱由检点头道，“魏忠贤虽死，但阉党余孽遍布朝野，若不彻底清除，东林党虽然反对阉党，但他们也有自己的利益诉求，若不能平衡他们的势力，也会给带来麻烦。”
秦良玉说道：“陛下深谋远虑，臣佩服不已。只是如今京城防务空虚，白杆兵虽精锐，但人数有限，若有外敌入侵或内乱发生，恐怕难以应对。”
“秦将军放心。” 朱由检说道，“朕也在筹备组建新军，待新军组建完成，京城的防务便会得到加强。另外，朕让你节制京畿卫戍兵马，就是希望你能尽快整顿京畿卫戍部队，提高他们的战斗力，确保京城的安全。”
“妾遵旨！” 秦良玉躬身应道。
“孙太傅，辽东是大明的门户，后金虎视眈眈，若辽东失守，大明便会陷入万劫不复之地。” 朱由检说道，“你前往辽东，整顿边军，修筑防御工事，选拔优秀将领，提高边军的战斗力。所需军饷与物资，朕会从皇家私库与国库中优先拨付，你不必担心。”
“臣遵旨！” 孙承宗躬身道，“陛下放心，臣一定尽快前往辽东，整顿边军，抵御后金入侵，绝不辜负陛下的信任。”
“很好。” 朱由检点头道，“二位卿家都是国之栋梁，大明的未来，就拜托你们了。日后若有任何困难，可直接向朕禀报，朕会全力支持你们。”
“臣（妾）遵旨！” 二人齐声应道，心中充满了感动与责任感。他们知道，皇帝对他们寄予了厚望，他们必须全力以赴，才能不辜负皇帝的信任。
国家安全部在骆养性的带领下，展开了大规模的清查行动。
皇宫内部的清洗工作也在王承恩的带领下顺利进行。
所有与阉党有牵连的宦官都被逐出皇宫，贪污受贿、为非作歹的宦官则被严惩不贷。同时，王承恩还选拔了一批忠诚可靠、能力出众的宦官，充实到皇宫的各个部门，确保皇宫的正常运转。
她对京畿卫戍部队进行了严格的筛选与训练，淘汰了老弱病残，选拔了一批年轻力壮、武艺高强的士兵；同时，她还推行了新的军事训练方法，加强了士兵的体能、武艺与战术训练，提高了部队的战斗力。在她的努力下，京畿卫戍部队的面貌焕然一新，成为了一支精锐之师。