段祺瑞往哪里放呢?
段祺瑞更是焦急，军队归编了，编成协了，若是兵权失去了，以后靠什么呢?昔日投考武备学堂和毕业于武备学堂，他都能考出最好的成绩；去德国留学，他依然考出好成绩。现在，要争军权了，他竟两考而落孙山，这不等于明明把军权丢了吗，这可怎么办呢?段祺瑞不能丢军权，丢了军权岂不连人格也丢完了吗?平时，他总是以在德国镀金自足，目空一切。现在好了，镀的金全磨光了，自己只剩下一块烂铁，多丢人呀!现在，回头想想，段祺瑞才明白，正因为留洋镀了金，才放松了上进。今天可好，就给个样儿看看!他虽焦急，却也想不出解救的办法。
正在此时，人传“总督大人请!”
段祺瑞闻得袁世凯请，脑门又一热。“是不是再来个面试?面试更难，再考不好，可就一切都完了!”他不想去。可是，不去是不行的，丑媳妇不能怕见公婆，硬着头皮也得去。段祺瑞匆匆去了总督府。
袁世凯正在焦急地等着他，二人面，袁世凯就开门见山地说：“芝泉，考试是咋回事?”
段祺瑞脸膛发热，说：“祺瑞平时失检点。粗心大意了。其实，大人出的题目，往日我都是挺熟的。”
“我想再考你一次，怎么样?”
段祺瑞尽管脸膛又热，不得不假装镇静。他不情愿地说：“祺瑞沉下心去，好好准备”。
“来不及了。”袁世凯说：“这不是临时抱佛脚的事。”“我今夜通霄达旦……”段祺瑞下决心了。
袁世凯背过身去，不再说话，只把手背过来，说：“拿去吧，今夜好好准备，我明天亲自带人考你!”说罢，便把右手摇了摇。
段祺瑞明白了，匆忙一个上步，从袁世凯手中接过折叠工整的 一张纸，一边后退，一边说：“谢大人教诲!”
段祺瑞想着袁世凯给他的，是提醒他要准备读什么书，找什么资料的提示呢。回家一看，原来就是一张考试的试卷。这一高兴，简直要发狂起来。于是，饭不吃、觉不睡，便伏在灯下，翻文找书，准备答案。
次日，果然是袁世凯领着几位京城来的大人面考。段祺瑞有准备了，无论笔试还是口试，都能对答如流。结果，总算渡过了这一关，他自然也考取了。于是，袁世凯堂而皇之地发委任，段祺瑞成了袁世凯新成立的第三协的统领。段祺瑞匆忙到袁世凯那里去表示谢忱，然后走马上任。
段祺瑞过了考试关，王士珍、冯国璋两个统领专程赶来为他道贺，自然免不了说一片“学富五车”、“胸有兵书”、“聪明机智”等等溢美之言。段祺瑞觉得王、冯二位都是知已，昔日情厚，今后还得共事，又都是一个祖宗麾下的部将，不能瞒着他们。于是，便把袁总督。传卷，的事透给了王、冯二人。并且对袁世凯表示了个“受恩深重，终身不忘，的忠心!不料，王、冯二人听罢，都暗自发笑——原来这两位也是“彼此，彼此!”只不过所采取的方法略有不同罢了。
段祺瑞做了北洋新军第三协统领的第二年，即l903年，袁世凯提请中央成立练兵处的奏折获准了。当然，“由皇族重臣来主持练兵”的议奏，也被同时核准。袁世凯本想待奏折恩准后再奏请由荣禄来充当总理这件事，谁知荣禄“无福”，袁世凯的奏折尚未获准时，荣禄竟一病去了，袁世凯不得不匆忙再奏，推举庆亲王奕勖来主持其事，他自己自然还是协办。
朝廷恩准了，派奕勖为督练新军大臣，袁世凯为会办大臣。
袁世凯抓到了督练新军的大权，他不待奕勖下手，便在练兵处设机构、派干将起来。袁世凯任命徐世昌为总提调，下边设三个司，王士珍为军正司正使，冯国璋为军学司正使，段祺瑞以直隶补用道充任军令司正使。
这一年，段祺瑞89岁，正是年富力强。
人走顺路的时候，什么好机遇都会碰到。段祺瑞作了军令司正使之后，练兵处在袁世凯的操纵下，开始了全国性的大扩兵运动，他决定在全国范围训练新军36镇，先在北洋范围成立6个镇，作为示范。其实，就是以北洋为骨干，把全国军队进而化一，成为自己的亲兵。
袁世凯雄心勃勃，但又觉得口张得太大，怕吞下去消化不了。他找到段祺瑞，要和他一起商量一个办法。
段祺瑞春风得意，又对袁世凯感恩戴德，梦里都想着为泰山效力。这几年，他能有这几步飞跃，他方才明白沈先生“护官符”提醒的作用，“即便你是好汉，也得结邦!”
段祺瑞坐在袁世凯面前，思索着袁世凯提出的问题，好一阵，才说：“先在北洋建立6镇，是一步好棋。这样，可以把骨干军队抓紧。我想这还不够，得让所有的镇都有咱的骨干才好。”
我也这么想，袁世凯说：“只是用什么办法，尚未考虑出来。”大人，我想这样，你看行不行?”段祺瑞想起了自己的出身，想起了自己发迹的途径，说：“咱们还办武备学堂。办短期的，一批批往下分。分配给各镇武备学堂学生，这是名正言顺的事。你看如何?”
袁世凯也曾想到这个