本要出兵的情报偷偷告诉沈惟敬，解释说这事我也不知道，都是加藤那兔崽子一手撺掇的。沈惟敬说那你们赶紧撤兵回来啊，小西一脸苦笑：事已至此，我无法阻止。你们干脆把人都撤出晋州城，让加藤清正夺个空城算了。反正他也守不住，他一撤你们跟着拿回来便是。
小西这个建议固然保藏祸心，但也不失为一个解决办法。沈惟敬连忙写了封信给李如松，告诉他们日本人的打算，建议不要硬碰硬，避敌锋芒为上。
李如松听到这个消息，顾不得鄙视日本人的出尔反尔，立刻命令诸军都不得轻举妄动。如果演变成两军主力对决，明军的分散状况会很危险。距离日军防线最近的刘綎，还特意给加藤清正写了一封信，劝他趁早打消这个念头，可惜加藤清正根本不予理睬。
眼看晋州城已是危如累卵，朝鲜军的大部分将领开始转向赞同沈惟敬的意见，干脆让个空城出来，何苦死扛。可是，由江华岛义军转正的倡义使金千镒坚决反对，他认为日本人的话不能信，万一他们打下晋州不撤了，那全罗道可就危险了。
金千镒纠集了庆尚道右兵使崔庆会、忠清兵使黄进等一批赞同自己观点的将领，带着各自部属进入晋州，守军总计有八千人。另外在外围还有一些朝鲜军与明军的小部队作为策应，刘綎还答应金千镒会派援军过来。
六月二十一日，日军主力抵达晋州城下，开始四面攻城。这是一次无比惨烈的围城战，日军出动了数万精锐与铁炮、龟甲车等武器，日夜不停地拍击城墙。整个晋州城陷入一片火海，到处险象环生。金千镒、崔庆会、黄进等人坚守城头，亲自指挥各种守城器械，抵死不退，打退了日军无数次进攻，守军也伤亡惨重，疲惫不堪。
从六月二十一日到六月二十九日，日军的攻势持续了九天。晋州城的高大城墙被连日大火烧得发脆，又被从天而降的大雨生生泡塌了一角。日军趁机一涌而入，绝望的朝鲜守军展开巷战，很快寡不敌众，逐渐被一一消灭。
面对蜂拥而至的日军，金千镒带着自己的儿子金象乾，与崔庆会等人跳入南江自尽。晋州就此陷落。
大概是知道这座城市是守不住的，日军在晋州城兽性大发，竟然灭绝人性地发动了屠城。城中的朝鲜军民死伤枕籍，血流成河，整个晋州城六万多居民，被屠戮一空，成为壬辰战争中的第一惨案。那些所谓的“日军名将”们平日里玩玩茶道，写写诗词，似乎风雅文明得很，可一闻到血腥，立刻便忘记了文明与人性，可见有些民族的有些本质，是从来不会变的。
在晋州发泄够了兽欲，日军留下满城的尸体，得意洋洋撤回釜山。明、朝两军看到晋州的惨状，都异常震惊，甚至连远在北京的万历皇帝听说后都对此表示不安。
除去道德上的谴责以外，宋应昌和李如松还有一件事急于弄清楚：日本人肆无忌惮地搞这么一出，到底还想不想谈和平了。按照文明世界的理解，在和谈期间玩这么一出大屠杀，等于是彻底撕破脸皮，没什么好谈的了。
他们去问沈惟敬，沈惟敬赶紧说谈啊，为什么不谈！对于晋州惨案，沈惟敬解释说这是日军内部不合所引发的，加藤清正不满小西行长的谈判斡旋，擅自开战，如果我们拂袖而去，便中了主战派的奸计。
这个解释勉强压服了宋应昌与李如松的怒气，沈惟敬擦了擦冷汗，又去试探日本人的心思。
结果他发现日本人完全没把晋州大屠杀当回事。他们觉得六万多条人命根本不算啥大事，该谈的事还得要谈，没有任何心理负担，反觉得自己多了几分威风，沾沾自喜。
在名护屋的秀吉听说日军在晋州大捷以后，兴奋得难以自抑，认为这一下明使会彻底屈服。他连夜召见玄苏，给了他一封书信，转给明方的两位谈判代表。
玄苏脑袋不糊涂，他一看秀吉的信件内容，差点哭了。
秀吉的语气大得出奇，他声称大明是个忘恩负义的国家，朝鲜是不知好歹的邻邦，不用大军教训一下你们是不知道本大人的利害，现在提出七点要求，答应了就赦免你们的罪过：
1明朝贡献一位公主，给天皇陛下当妃子。
2恢复堪合贸易。
3明日两国永誓盟好
4汉城与西四道归还朝鲜，东四道割让给日本
5朝鲜送一位王子到日本当人质
6日本释放两位王子与陪臣
7朝鲜发誓永远不背叛日本
玄苏眼前一黑，差点没晕倒。这已经不是和谈了，这是要逼着大明签城下之盟。这个要求一递过去，肯定炸锅，根本就是一封宣战书。
“这全都怪黑田那个家伙啊。”玄苏恨恨地骂道。
原来当初宇喜多秀家给秀吉写信请求撤军时，生怕秀吉因此而生气，用了黑田长政的主意，把实际情况描绘为“日军大胜，明军乞和”，这才换来秀吉的撤退首肯。
秀吉本来是个聪明人，可他的年纪不小了，脑子已经糊涂。他每天呆在名护屋里，对战况的把握完全来自于前线将领的书信，而那些