里的兵运工作。
当时，党组织依然遵循党在白区工作的方针，即“长期埋伏，隐蔽精干，积蓄力量，以待时机”，要求刘运宗在不损害革命利益的前提下，取得其上级的信任，站稳脚跟，学会在敌人军纪控制森严、严禁秘密结社的军队里传播革命道理，发展建立革命组织的本领。
当时，警卫营第一任营长穆锦春与副营长龙云沛之间素有矛盾，穆以营长职位独揽人事、财务大权，不把龙云沛放在眼里。龙云沛因不能插手营里的事务而对穆不满，并仗着他与卢汉的姻亲关系而不卖穆的账。穆、龙互相倾轧。穆思想反动，布置亲信监视进步分子的活动，刘运宗在营内的活动一度曾引起穆的怀疑，这对党的秘密工作威胁很大。
依据党的对敌斗争策略“发展进步势力，团结争取中间势力，孤立打击顽固势力”，刘运宗决定充分利用龙、穆之间的矛盾，争取龙云沛，打击穆锦春，只有这样才能在警卫营中站稳脚跟。
1947年10月，龙云沛举办婚事，四连部分官兵前去帮忙，留下事务长刘运宗在连里执勤。刘运宗集合星期天值班士兵安排补假，被穆锦春发现。穆借口追究刘未请示报告，将刘禁闭起来，并亲自搜查刘的书籍，企图加害于刘，进而追究龙云沛包庇重用刘运宗而达到将龙云沛挤走的目的。幸得刘运宗同室的排长郑运询的掩护，穆锦春搜查一无所获。龙云沛回营得知就事后，对穆大为不满，与穆大吵了一场，并迫穆释放了刘运宗，事后，刘运宗便向龙云沛检举揭发穆锦春私自动用原特务团的生产资金做棉纱股票生意中饱私囊，冒领，贪污粮饷，排斥打击昭通(龙系昭通人)势力等情况，加深了龙对穆的不满。龙云沛乘穆锦春贩运枪弹案发之机，向卢汉告发了穆的罪行，结果穆锦春被撤职查办，由龙取代穆当上了警卫营营长，并随后调走了穆的亲信。
在党的正确方针指引下，刘运宗通过这场斗争不仅保护了自己，站稳了脚跟，还进一步取得了龙云沛的信任，于1948年4月被提升为三连排长，在同年8月成立营直属特务排时又调为特务排排长，担任卢汉办公厅及翠湖住宅的警卫任务，成了名副其实的卢汉贴身卫队长。党在警卫营的斗争，首战告捷。
1948年4月，刘运宗介绍二连事务长张义、三连班长杨汉清参加“民青”。7月，刘运宗的组织关系转归中共昆明市工委负责人高志远领导的敌情工作组，由吉星明负责联系。市工委敌情工作组专门领导在“敌人心脏里烧锅煮饭”的工作。对警卫营的工作，高志远专门指示：“不要再等，要争取教育，发展组织，巩固地盘，伺机进攻，搜集情报，为我所用”。发展组织时，按照“发展下层，团结中层，争取上层”的原则进行。紧接着，在长期扎根串连的基础上，刘运宗便又介绍了下层士兵朱继洲、张忠贵、鲁以华、高家秀、李玉祥、侬玉柱，排长郑运询，军医殷俊才等参加了“民青”。
1948年9月，昆明市工委正式成立以高志远为领导的敌情工作小组(简称敌工小组)，成员有吉星明，田培宽。敌工小组认真分析总结了此前在警卫营的工作，认为，过去一段时间的工作经验证明：在敌人控制森严的部队里开展兵运工作，应当绝对审慎秘密，方式方法不同于学运工作。根据党的“团结进步力量，争取中间力量，孤立打击顽图势力”的方针，党在警卫营的工作重点和基础是团结广大下层士兵。刘运宗根据组织要求，继续采取过去行之有效的工作方法，与士兵打成一片，关心他们的疾苦，为他们排忧解难，仗义执言，向长官争职合法权益，与他们交知心朋友，谈心诉苦，并因势利导，启发其阶级觉悟，引导他们认识解放哉争胜利形势和日益高涨的昆明学生爱国民主运动，并在此基础上组织秘密读书会，传阅进步书刊，待时机成熟时即吸收积极分子参加党的秘密外围组织“民青”；还领导“民青”组织成员学习《目前形势和我们的任务》、《在晋绥干部会议上的讲话》、《古田会议决议》等党的文件，并定期传阅秘密刊物《新华电讯》。
组织同乡会，联络感情。这种形式易为一般在外吃粮当兵的士兵及下层官所接受。在同乡会中，广泛地把士兵团结在我们周围，从中发现并掊养积极分子参加党的外围组织。刘运宗利用招募新兵的机会，在新兵中组织了宜良、嵩明、晋宁、江川、华宁昭通等六个同乡会。
为了把士兵团结在我们周围，刘运宗还利且一切可以利用的机会以及自己身为事务长的合法身份，以稳定部队为由，说服龙云沛改善士兵生活，活跃士兵文化生活，成立伙食委员会，由士兵轮流担任采购，民主管理士兵伙食，用节余粮款及空缺粮饷购买肥皂发给士兵。同时利用伙食委员会这一公开合法组织秘密进行革命活动。1948年刘任排长后，带领全排士兵到西山卢汉住宅值勤时，还请渔民到警戒区内捕鱼分成，改善士兵生活，购买文具用品发给士兵学习文化。还组织“小先生”互教互，每周开一次学习评论会，启发士兵的民主意识。
1949年11月，敌工小组决定接收李富入党，介绍人为刘运宗，由田培宽负责为其办理入党手