西满工作的领导，决定加强西满分局，由李富春任分局书记兼军区政委，黄克诚为分局副书记兼军区副政委，军区司令员由林彪兼任，吕正操、李运昌为军区副司令员。
在11月的一个月之内，东北人民自治军总司令部陆续将整个东北划分成若干军区。先后成立的有：锦热军区、嫩江军区、吉林军区（又称东满军区）、北安军区、松江军区、三江军区（又称合江军区）、辽东军区、辽宁军区、辽北军区。其中，军事力量较强的是以下几个军区：
辽东军区，司令员兼政委萧华；辽宁军区，司令员张学思，政委白坚；辽北军区，司令员倪志亮，政委郭述申；吉林军区，司令员周保中，副司令员万毅，政委张启龙；北安军区，司令员叶长庚，政委王鹤寿；松江军区，司令员卢冬生（卢牺牲后为聂鹤亭），政委张秀山。
11月底，东北人民自治军的总部由沈阳移到本溪。
这样，东北的党政军领导班子和各级指挥机构大体就绪。