蒋介石见卫立煌不听他的命令，于是拉拢廖耀湘。在南京国防部召开的军事会议上，蒋介石当众宣布：只留第53军和第207师守沈阳，其余部队统编为机动兵团，由廖耀湘指挥。
卫立煌得知这一计划害怕廖耀湘把主力拉走，于是坚决反对成立机动兵团。这样一来，廖耀湘与卫立煌之间产生了矛盾。
蒋介石随后又召见沈阳防守司令梁华盛和第7兵团司令官刘安琪，再次提出打通沈锦线。二人都害怕这个任务落在自己的肩上，有被解放军半途吃掉的危险，因此，都不同意蒋介石的计划。
蒋介石一心要实行自己的计划，他必须找一个能听话的人。他首先让廖耀湘率沈阳主力打到锦州，如果廖耀湘照计行事，就让他取卫立煌而代之。结果廖耀湘受到卫立煌的牵制无法行动，于是蒋介石又看准了锦州的范汉杰。示意范汉杰，只要打通了沈锦线，撤出东北主力，就将卫立煌的权力交给他。
结果，蒋介石打通沈锦线撤出东北主力的计划无法实现，反倒闹得卫立煌与部将矛盾重重，无法统一指挥。
蒋介石有飞机，因此，他与部将的争论基本上是面对面的。而毛泽东与林彪只能在电报里争论。
冬季战役正在进行时，毛泽东于2月7日致电林彪、罗荣桓、刘亚楼：“蒋介石曾经考虑过全部撤退东北兵力至华北……对我军战略利益来说，是以封闭国民党军在东北加以各个歼灭为有利。”
冬季战役结束后，东北已经没有小仗可打。要打只能在长春、沈阳、锦州三点上选择。林彪对采取什么方法打一直举棋不定。他整天在地图前“打坐”，迟迟定不下决心，急得罗荣桓和刘亚楼团团转。毛泽东的电报频频传来，罗荣桓和刘亚楼的建议也在林彪的耳边时时响起。林彪对此一概视而不见，充耳不闻，照旧在心里把他关于战争的“算盘珠子”不紧不慢地拨弄。
毛泽东的想法是：切断东北与华北的联系造成“关门打狗”的态势，将东北之敌就地歼灭。很显然是要先打锦州。
林彪认为锦州城防工事坚固，又有15万重兵把守，如果像夏季战役攻打四平那样久攻不下，敌人援兵上来将造成被动。四平撤退之所以安然无恙，是因为部队基本上是轻装。要打15万人设防的锦州，必须有大规模的重武器和六七十万人的后勤供应，这样庞大的供给需要大量的汽车和油料，如果油料耗空或遭空袭，大批机械化装备将要丢给敌人，部队就难以安全撤离战场而陷于危险境地。
林彪不愿冒险攻锦州，他认为长春之敌最弱，又离解放军后勤基地最近，长春与沈阳相距五六百公里，沈阳之敌出援困难，且远水难救近火。于是，林彪在反复考虑之后决定打长春。那时林彪在东北已经树起了“军事权威”的形象，他确定的军事方案一般是没有人提出异议的。虽然东北局对下一步军事行动进行了反复讨论，但是最终定下的还是林彪的方案。
这一方案报到西柏坡，毛泽东看后大发雷霆。他把燃着的一支烟在手中捻碎，对周恩来道：“又是一个将在外君命有所不受，我看他胆子太小，二月就叫他南下北宁线，两个多月了，还是这个态度，要不然我去东北算了。”
周恩来看了一会儿电报，道：“主席，我看只能原则上同意他们的计划，再次申明南下北宁线的重要性。”
毛泽东道：“也只好如此了。”
4月22日，毛泽东同意了林彪的计划。5月中旬，林彪用两个纵队试打长春，结果发现长春守敌比原来估计的要强大，于是改强攻为“长围久困”。东北局讨论决定以一部兵力围困长春，主力南下作战。
毛泽东接到东北局这一计划，扔下饭碗，走过去拿起毛笔自语道：“这个弯子好难拐哟。这是不见棺材不掉泪。”他坐下来写道：“攻击长春既然没有把握，当然可以停止这个计划，改为提早向南作战的计划。”
随后，毛泽东又明确指出：“应当首先考虑对锦州、唐山作战。”
林彪在雨季中又“面壁”了十几天，终于定下决心，准备雨季结束后，南下打锦州。8月14日，东北野战军领率机关正式组建，林彪任司令员、罗荣桓任政治委员、刘亚楼任参谋长、谭政任政治部主任。
9月初，东北野战军做了政治动员，随后挥师南下。在兵力部署上，林彪准备将7个纵队、6个独立师置于新民、沈阳及长春之间，以便应付沈阳敌人出援和长春守敌突围，这使攻打锦州及外围的兵力薄弱。毛泽东由此看出林彪攻打锦州的决心不大，还有顾虑，于是9月7日指示：
你们如果能在九、十两月或再多一点时间内歼灭锦州至唐山一线之敌，并攻克锦州、榆关、唐山诸点，就可以达到歼敌十八个旅左右之目的。为了歼灭这些敌人，你们现在就应该使用主力于该线，而置长春、沈阳两敌于不顾。并准备在打锦州时歼灭可能由长、沈来援之敌。
义县攻坚
9月12日，辽沈战役首先从北宁路山海关至唐山段打响。第11纵队和冀察热辽独立师突然包围，并迅速攻歼昌