疗上，表里经理论都具有重要指导意义。针灸临床上选经配穴理论中“阴病取阳、阳病取阴、阴阳经并取”的治则就是据此建立的。
二是同名经。同名经是根据阴阳理论结合脏腑的生理、病理总结归纳出来的；概括了手足两经连接延续的特点，从而显示出所归属的两脏或两腑在生理、病理、诊断、治疗上的密切关系。针灸临床中，大量的同名经配穴组合就是据此理论建立的。
三是相生相克经。根据脏腑五行属性，在一定条件下，经络依其所属脏腑也能产生“有益”或“制约”的治疗作用，五输穴及其选经配穴就是据此理论建立的。后世建立的子午流注针法、灵龟八法等也与此有关，只是后者突出了时间对脏腑、对疾病、对治疗的决定性作用，这里不做讨论。