柴田大败的消息，神户信孝以下以及守城兵的士气都极其低落。虽然在城中还有一铁的外甥齐藤利尧和稻叶刑部等，但还是有很多所谓的美浓同族都出了城，投靠了羽柴军。
结果，城里陷入了只剩下二十七人的惨状，最终三七信孝也逃出了城，从长良川坐船到了木曾川，投奔到了尾张知多那边。
根据《丰鉴》《武家军纪》等的记载：
“三七信孝和柴田最后都被斩草除根了，就连随从家臣都难逃一死，只有平日行善积德的人被留了下来。”
信雄跟随着尾张的势力，把城包围了起来。信孝派遣使者到尾张去，然后出了城，乘船到了知多的宇津美。在那儿，信孝想要命令中川勘右卫门杀死自己，但觉得还未到时候，于是当他把所有的事情都处理完毕以后，悄悄地拿起刀自杀了。
后来，信孝的尸体由他的兄弟织田信雄巧妙地运了出来，为他处理了身后事。
当然指示信雄这么做的无疑就是秀吉。因为如果直接由自己的军队对拥有主公血统的信孝下手的话一定会惹人非议，所以秀吉就借信雄的手来做此事。
对于这件事，后世指责秀吉的历史评论也不少，比如山鹿素行的《武家事纪》就说道：
“秀吉和毛利和谈，在山崎讨伐光秀，以及在出席清洲会议的时候，绝对没有想要夺取天下的志向。但是，在信义前面的虽然是一条没有终点的路，但等天下的大事暂且结束之后，以胜家为首的信雄、信孝的家族长公们还有一益等以前的重臣们的策略，全都不如信义，而且智谋不足，反而将吞并天下的希望及根基素养全都寄托给秀吉。”
还有，在素行的同一本书中，关于这个问题还做了如下结论：
“……这并不是说秀吉丧失了正义。这一切都是信雄、信孝强加于他的。”
虽然大多数的评论对于这个结论都没有什么异议，但对于从中国地区到山崎之战这段时间，说他还没有夺取天下的野心，果真如此吗？
不管怎么说，毫无争议的就是不管是信雄还是信孝，这兄弟俩都只是凡庸之辈。假如，兄弟俩能齐心协力的话，又或者，其中能有一人具备果断的性格，并有辨别时势的慧眼，那么肯定不会沦落到今天这样的下场。
与信雄的资质平庸相比，信孝还算有一点点骨气。他虽然只是一个毫无才略、固执的人，但在逃到尾张野间的时候，他最后在一间寺庙里切腹自杀的样子真的是有“怎么会沦落到这种地步”这种觉悟的样子，还是有点骨气的。
以前，在野间的安养院里，寺庙收藏了一幅墨梅的古画，说是织田信孝在自杀的时候，挂在屋里床上的一幅画。这是一幅能看见血迹，缅怀往昔，看着都觉得哀伤的画。后来，狩野衲永在画上面题了一首诗：
夜窗如梦到西湖，月下见花思老逋，
忽有钟声来呼醒，举头半幅墨梅图。
信孝，终年二十六岁。
自杀的时候据说是五月七日。
七日当天，秀吉踏入安土，十一日驻扎在坂本。
在伊势潼川的一益最终也投降了。秀吉给他斟了茶，还在近江给了他五千石俸禄，并没有深究他以前的罪行。