员组成组成小队的基本单位不变。
在部长之下情报组与行动组两个部门。
而后情报组又分为：军事情报大队，安全情报大队，通讯情报大队。
行动组分为：警卫大队，刺杀大队，审讯大队。
这两组六大队除了专业任务不同之外没有高下之分，而且要求保有相同的正面战斗力，具体功能可以顾名思义，就不一一解释。
按照绳树的计划，各大队由3o到4o个暗部小队组成，且每十个小队组成一个中队由一名中队长统领，整个暗部的成员至少千人，未来如果条件允许，他还会在本国与敌国城镇建立分部。
分部的结构与总部类似，但是规模要小上是被，分部的最高长官叫作“站长”。除了与绳树这个部长以示区别之外，也是为了满足他自己的恶趣味。1