中央军委的指示再一次坚定了四野歼敌的决心，林彪等人完全理解了中央军委和毛泽东的战略意图之后，经过反复研究，最后确定了作战部署：
除第42、第48军分别留置河南、江西，担任工作队任务外，以第12、第13、第15兵团和第二野战军第4兵团，分三路向中南进军。
以第13兵团的第38、第39军为西路军，在司令员程子华指挥下，担负右翼战略迂回任务，从常德取道沅陵、芷江，直插柳州，切断白崇禧集团西逃贵州的道路。
以第4兵团的第13、第14、第15军和第15兵团的第43、第44军及两广纵队为东路军，在第4兵团司令员兼政治委员陈赓统一指挥下，从赣州经南雄、始兴南进，在华南游击队的配合下，分三路合围广州，切断余汉谋集团由海上逃跑的退路。
以第15兵团和两广纵队经营广东，第4兵团继续西进，经阳江向桂南挺进，成为合围白部的南路军，切断白崇禧集团南退雷州半岛、海南岛的道路，与西路军形成对白崇禧集团的钳形包围。
以第12兵团的第40、第41、第45、第46军和第13兵团第49军为中路军，在第12兵团司令员兼政治委员萧劲光指挥下，于湘南地区寻机歼灭白崇禧集团部分主力，尔后，第46、第49军留置湖南执行工作队的任务，第40、第41、第45军沿湘桂路两侧入桂，协同西路军、东路军全歼白崇禧集团于广西境内。第47军主力集结于湘西永顺、大庸地区，协同湖北军区部队监视位于湘鄂西地区的宋希濂部，保障西路军翼侧安全，并掩护第二野战军主力入川前的集结。第5兵团的第18军暂归第12兵团指挥，进至安仁以西，以保障中路军左翼安全。