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回到香港，连贯立即将周恩来布置的工作向方方、尹林平作了汇报。
港粤工作委员会遵照周恩来的指示，积极做好迎接上海、南京、重庆等城市的地下党组织和民主人士转移到香港的准备。
10月2日，周恩来召集中共代表团驻沪办事处人员开会，分析谈判破裂形势，进行气节教育，动员大家准备迎接新的考验。
周恩来说：国共和谈至今1年有余，现在看来是不会有任何结果的。我们在南京、上海的日子不会多久了，因而，中央决定要分批撤退。
会后，根据组织部长钱瑛的建议，布置了干部的去留及转移工作。从事秘密工作的刘少文、吴克坚等作为第一批转移人员，陆续转入地下工作，不再与代表团发生关系。周恩来还特地叮嘱范长江，通知已暴露身份的记者陆诒离开上海，以免发生事变。
《群众》杂志实际是中共代表团的发言机关，在上海总是受到国民党特务机关的查抄，因此决定到香港创办香港版。周恩来指示上海工委副书记章汉夫带范剑涯先遣去香港，筹办《群众》杂志香港版的出版工作。
章汉夫、范剑涯原来计划乘飞机去香港，周恩来知道后，当即提出了严肃批评。他说：你们经常参加公开活动，在国民党特务的名册上是挂了号的。你去飞机场，正是自投罗网，国民党特务如果在飞机场把你们绑架，就麻烦了。一定秘密行动。最好乘外商的轮船走。
经过研究，章汉夫化装成一位金融界人士，范剑涯扮成章的秘书到港办理公务，半夜里雇了一条小船，登上停泊在黄浦江上的一艘英国货运轮船到达香港。在香港，在香港分局的饶彰风等同志的配合下，1947年1月，《群众》杂志香港版正式出刊。
不久，周恩来又派乔冠华和龚澎夫妇到香港创办《今日中国》（英文）半月刊和有利印务公司和新民主出版社。
接着，周恩来派夏衍到新加坡了解当时流散在南洋各地的文化界人士的情况，并向海外侨领传达第二次国共分裂后我党的方针政策，以后，许涤新、方卓芬、刘宁一等也先后离沪去香港。
为巩固我党在香港的建立的阵地，把香港分局建设成疏散、隐蔽的堡垒，周恩来在许涤新夫妇离沪时，亲自来到许涤新的宿舍，找到许和他的夫人，当面分配他们去香港后的工作。由于许涤新过去一直负责对工商业人士统战工作，当听到要他负责工商业统战、宣传和工委的财务管理工作时，流露出对财务工作信心不足。周恩来说：好好在工作中熟悉，相信你能完成这个任务。
突然，周恩来向许涤新提出了一个他没有想到的问题。他问许：袁雪芬的越剧你看过没有？
“我没有时间，而且也看不懂，所以没有看。”
像几年前在重庆时，他要求许涤新听梅兰芳的京剧一样，对许涤新说：越剧在上海具有浓厚的人民性，娘姨也都爱看，你是知识分子，为什么不看一看？现在时间还来的及，你同卓芬去看一场越剧后再乘船到香港。
9月27日，周恩来致电中共中央：我当尽量利用马歇尔回国之前的时机，完成疏散和工作布置。并说明：我在马走前必可回延。
由于周恩来的周密细致的安排，疏散工作有条不紊地进行，凡已经暴露，引起国民党当局注意的通过不同的途径，有的返回延安，有的转去香港，有的到东北或山东解放区。对于留下来坚持工作的同志，周恩来除了教育大家要经受得住艰险环境的考验外，更多的是以革命乐观主义精神给他们以鼓励。